Những thách thức của hệ thống thông tin y tế hiện nay:
- Nhu cầu số liệu ngày càng tăng tại tất cả các tuyến.
- Việc thực thi hoạt động tại các tuyến, đặc biệt là tuyến dưới luôn:
+ hạn chế về nguồn lực
+ nhân lực thiếu kinh nghiệm, quá tải, thiếu nhân viên và năng lực về xử lí và phân tích số liệu còn hạn chế
- Thiếu công cụ
- Không có phản hồi từ tuyến trên
- Sử dụng thông tin chưa hiệu